През територията на общината преминава електрифицираната ЖП линия – София – Кулата. Тя е една от най-натоварените линии в страната. От същата линия при гр. Дупница има разклонение за гр. Бобов дол. 100% от железопътната мрежа в общината е електрифицирана, а контактната мрежа от над 10 години. От гара “Дяково” дължината на ЖП линията възлиза на 16,128 км., и коловозно развитие – 2,135 км. Коловозното развитие на гара “Дупница” е 6 072 км. Отсечката е част от ЖП коридор Видин-София-Кулата, който е включен в списъка с приоритетни проекти за развитието на Транс-европейската транспортна мрежа до 2020 г. Линията включена в Европейското споразумение за най-важните линии за международни комбинирани превози и свързаните с тях обекти (AGTC). ОП „Транспорт“ предвижда линията да бъде осигурена с оборудването от модерни системи за сигнализация и телекомуникация на железопътни отсечки (по Трансевропейската транспортна мрежа). Гъстотата на железопътната мрежа в общината възлиза на 59.4 км/кв.км. при 42 – 46 кв.км. за областите от региона за планиране и водещото му място в това отношение за страната.
Осъществяването на големите национални транспортни проекти ще подобри значително транспортната достъпност на територията на община Дупница и мобилността на жителите й. Предизвикателство пред местните власти е осигуряването на транспортния достъп по пътищата-общинска собственост. За състоянието на уличното и пътно стопанство в общината е трябва да бъде изработен подробен анализ и стратифициране на решенията за преодоляване на проблемите свързани със състоянието, ремонта и стопанисването на уличните настилки. Необходими са инвестиции в подобряване състоянието на уличната и тротоарна настилка, вертикалната и хоризонталната маркировка, както и в създаването на ефективна система за управление и контрол на действията на всички заинтересовани страни при експлоатиране и ползване на улиците и общинските пътища.
На територията на Община Дупница няма населено място без транспортен достъп. Всички междуселищни пътища в общината са асфалтирани, с изградена съпътстваща инфраструктура. В град Дупница е осигурена светлинна сигнализация и регулиране на възлови градски кръстовища. Над 25 000 лева са вложени в модернизирането на тези системи.
Осигурено е транспортно обслужване с бързи и пътнически влакове на населението на град Дупница и селата Джерман, Яхиново, Дяково, Делян. Функционират ЖП гара Дупница в съседство с автогара Дупница. Посредством които се осъществява железопътната или автобусна връзка, както със селища на територията на общината, така и със селища на територията на страната. В селата Джерман, Яхиново, Дяково и Делян действат и железопътни спирки. Поддържат се четири градски линии за обществен транспорт. Първите три линии обслужват населението на град Дупница. Четвърта линия осъществява междуселищния транспорт на територията на общината до селата в община Дупница. Услугата се осъществява от частни превозвачи по договор с община Дупница и одобрено разписание и цени на билетите.
Населението на града и селата в Общината ползва услугите и на 3 таксиметрови компании. По данни на Общинска администрация, 80% от населението на общината е с подобрено транспортно обслужване. Транспортният парк в Общината е на възраст от около 20 години и е изцяло частна собственост. Това поставя множество предизвикателства пред собствениците, не само от гледна точка на поддръжката и експлоатацията на автомобилите за превоз на пътници и товари, но относно възможността да бъдат конкурентни на националния и международните пазари на транспортни услуги.